تدار “المرأة للمرأة” من قبل هيئة جماعية (كولكتيف) مفتوحة أمام جميع النساء. تجتمع هذه الهيئة مرة كل شهر، وفيها، نرسم سياسة التنظيم وطرق عملنا. تُتخذ جميع القرارات بالإجماع، توافقاً مع رأي المشاركات في الهيئة الجماعية. هيكلية الجمعية أفقية وبدون هرمية – لا يوجد إدارة ولا مديرة. تُنتخب جميع المؤسسات وفق طريقة الأرباع – التمثيل المتكافئ للنساء الفلسطينيات والشرقيات ومثليات الجنس والغربيات (أشكنازيات).